De acordo com o ATO DA REITORIA Nº 0546/2020, o Decanato de Pesquisa e Inovação (DPI) possui a seguinte estrutura organizacional:

I        Decanato de Pesquisa e Inovação — Decano(a);

II       Secretaria Administrativa (SEC-ADM);

III      Área de Apoio Técnico e Operacional (ATO):

a) Núcleo de Tecnologia da Informação (NTI);

b) Núcleo de Gestão Predial (NGP);

c) Núcleo de Comunicação e Eventos (NCOM).

IV     Assessoria (Assessoria);

V      Diretoria de Pesquisa (DIRPE):

a) Coordenação de Acompanhamento e Avaliação de Pesquisa e Inovação (CAAPI);

b) Coordenação de Fomento, Disseminação e Internacionalização da Pesquisa e Inovação (CoFoDIPI);

c) Coordenação de Infraestrutura de Pesquisa e Inovação (CIPI);

d) Núcleo de Apoio aos Comitês de Ética em Pesquisa (NACEP).

VI     Diretoria de Apoio a Projetos Acadêmicos (DPA):

a) Coordenação de Análise e Instrução de Projetos (CAIProj);

b) Coordenação de Acompanhamento e Controle (CACProj);

VII    Diretoria do Núcleo de Inovação Tecnológica/Centro de Apoio ao Desenvolvimento Tecnológico (NITCDT):

a) Conselho Superior (CS/NITCDT);

b) Assessoria e Secretaria Administrativa (SEC-ADM);

c) Coordenação de Inovação e Transferência de Tecnologia (CITT);

1.  Núcleo de Propriedade Intelectual (NUPITEC);

2.  Núcleo de Comercialização de Tecnologia e Serviços Tecnológicos (NCST);

d) Coordenação de Empreendedorismo e Desenvolvimento Empresarial e Social (CEDES);

1.  Núcleo de Multincubadora de Empresas (NME);

2. Núcleo de Empreendedorismo (NE);

e) Coordenação de Administrativa e Financeira (CEAD);

f) Programa de Pós-Graduação em Propriedade Intelectual e Transferência de Tecnologia para a Inovação (PROFNIT).